Des vagues de missionnaires
ont été envoyées dans le monde depuis 1960.
JEM a été conçu en 1956, par Loren Cunningham, un étudiant de 20 ans dans un institut de théologie des Assemblées de Dieu aux États-Unis. Alors qu’il voyageait aux Bahamas, il a eu une vision sur une organisation qui partagerait la Bonne Nouvelle du Royaume de Dieu sur tous les continents.
L’organisation est fondée aux États-Unis en 1960 par Loren Cunningham et Darlene, sa femme. La première mission a eu lieu au Liberia pour construire une route à travers la jungle afin de desservir un centre pour lépreux.
En 1964, l’organisation est devenue non-dénominationnelle.
JEM a été affiliée à l’ONG humanitaire chrétienne Mercy Ships depuis sa fondation en 1978 jusqu’à 2003.
En 1983, JEM a reçu le statut d’organisation de jeunesse au sein de la Fédération protestante de France.